Von der Gemarkung Werbach sind Funde verschiedener vorgeschichtlicher Zeitstufen bekannt geworden, unter denen ein großes Gräberfeld der Hallstattzeit (Kelten) hervorzuheben ist.

Bedeutend ist der 1826 gemachte Fund eines Grabes des späteren 4. Jahrhundert nach Christus. Das Grab, wohl Doppelgrab von Mann und Frau, bezeugt einen alemannischen Adelssitz, wie er auch in Gerlachsheim in ähnlicher Lage zum Taubertal nachweisbar ist (Germanisches Nationalmuseum Nürnberg).

Die später einsetzende fränkische Kolonisation ist belegt durch ein kleines Gräberfeld östlich des Ortes, das 1926 entdeckt wurde. Bei Werbach zwangen am 24.07.1866 preußische Truppen die im Verband des VIII. Bundesarmeekorps kämpfenden badischen Truppen unter dem Prinzen Wilhelm zum Rückzug.